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2021.09.24更新
本文档Rmd是R Markdown文件,如果你还不会使用R Markdown,请你一定学习一下,因为这是个革命性的写作工具,我已经在医咖会出了新课 欢迎大家来学习
课程地址 R Markdown学术写作系列教程
课程源码 https://gitee.com/hao203/rmd_china
网络药理学(系统药理学)自动化 Network pharmacology / systems pharmacology auto-analysis
视频教程地址 https://www.bilibili.com/video/BV1mK4y1D7AZ
分为两部分,一个是别人用python做的程序,可以直接用来进行tcmsp的爬取和Uniprot的ID转换,当然加Symbol也不在话下。 快速爬取TCMSP并进行uniprot的ID转换
另一个是我自己做的程序,主要是通过R语言的rvest包进行爬取,并进行自动化处理 适用于旧版TCMSP https://old.tcmsp-e.com/,文件名为tcmsp auto old.Rmd
另一个是新版TCMSP https://tcmsp-e.com/。由于新版需要登录验证,暂时无法实现自动爬取,需要手动复制一下,但也比一页一页手动要强太多。
remotes::install_github("tidyverse/rvest")
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