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CNAT--The complex network analysis tool
注:
1,这是自己利用业余时间开发的一个项目,难免有所缺陷和不足,希望各位仁兄提出宝贵意见和建议,不断改进。
2,希望更多的开源爱好者加入项目,完善功能。
3, 未来需要添加的功能有:社区划分、分形、可视化等等。
4, 该项目使用国际编码方式UTF-8,Windows下的编码方式为GBK,所以在导入工程后通过修改项目的属性来更改项目的编码方式。
5, usr目录是用户目录,所以该目录内的文件注释不是很详细
功能:
- 网络图构造:模型建网和真实数据建网(支持.net文件)
- 多网络的对比:新生节点和连接,消失的节点和连接,稳定的节点和连接
- 网络特征量分析:度分布,核层次性,聚类系数,紧密度,节点和边介数,路径, 匹配系数。
- 多种网络模型:
* 随机模型:随机网络模型,全局耦合网络模型,最近邻耦合网络。
* 小世界模型:WS小世界模型,NW小世界模型。
* 无标度模型:BA模型,适应度模型
* Internet模型:PFP模型
- 地震网络模型
- 链路预测评价指标
* AUC
* Precision
- 链路预测算法
* 基于相似性
* 基于最大似然估计
文件目录结构:
++| 目录
--| 文件
--> 变量
==> 函数
>> 枚举
\\ 注释
++| src
++| core --------------------------------------\\核心文件
--| Global.java -----------------------------\\全局配置文件
--| AbstractModel.java ----------------------\\网络模型抽象类
--| Edge.java -------------------------------\\网络中的边
--| Node.java -------------------------------\\网络中的节点
--| InterfaceNet.java -----------------------\\网络操作接口
--| Network.java ----------------------------\\网络操作类
++| feature -----------------------------------\\网络特征量计算
--| AssortativeCoefficient.java -------------\\匹配系数
--| Betweenness.java ------------------------\\介数,有向和无向
--| Closeness.java --------------------------\\紧密度,有向和无向
--| ClusterCoefficient.java -----------------\\聚类系数
--| Degree.java -----------------------------\\度
--| MultiNet.java ---------------------------\\两个网络的节点和边的比对
--| Path.java -------------------------------\\路径(最短路径,最短路径树)有向和无向
--| PCB.java --------------------------------\\无向网络中最短路径、介数、紧密度、网络直径的计算
++| linkPrediction ----------------------------\\链路预测算法
++| evaluation ------------------------------\\评价指标
--| AUC.java ------------------------------\\AUC评价指标
--| Precision.java ------------------------\\Precision评价指标
++| similarity ------------------------------\\基于相似性的链路预测算法,
++| global --------------------------------\\基于全局性的相似性链路预测算法
--| RWR.java ----------------------------\\RWR算法
++| local ---------------------------------\\基于局部的相似性链路预测算法
--| CN.java -----------------------------\\CN算法
--| AA.java -----------------------------\\AA算法
--| RA.java -----------------------------\\RA算法
++| quasi ---------------------------------\\基于半局部的相似性链路预测算法
--| LP.java -----------------------------\\LP算法
--| LRW.java ----------------------------\\LRW算法
--| SRW.java ----------------------------\\SRW算法
--| Similarity.java -----------------------\\相似性链路预测算法抽象类
--| LinkePrediction.java --------------------\\链路预测抽象类
++| model -------------------------------------\\网络模型
++| earthquake ------------------------------\\地震模型
--| OFC.java ------------------------------\\OFC地震模型
--| RealOFC.java --------------------------\\真实地震数据在时序上建网,且仿真能量倒塌
++| internet --------------------------------\\Internet网络模型
--| PFP.java ------------------------------\\PFP模型
--| RandomNetwork.java ----------------------\\随机网络模型
--| GloballyCoupledNet.java -----------------\\全局耦合网络模型
--| NearestNeighborCoupledNet.java ----------\\最近邻耦合网络模型
--| WSNetwork.java --------------------------\\WS小世界模型
--| NWNetwork.java --------------------------\\NW小世界模型
--| BANetwork.java --------------------------\\BA模型
--| LocalWorldEvolvingNet.java --------------\\局部世界演化模型
++| usr ---------------------------------------\\用户目录
++| util --------------------------------------\\工具箱
++| plugin ----------------------------------\\插件
--| EarthquakeRenormalization.java --------\\地震网络的重整化,划分格子
++| other -----------------------------------\\其他
--| INode.java ----------------------------\\FibonacciHeap
--| CreateNetFile.java ----------------------\\由只含有边关系的网络文件转换成.NET文件
--| ExtractASByLink.java --------------------\\提取AS网络
--| ExtractIPByLink.java --------------------\\提前IPv4网络
--| ExtractIPv6ByLink.java ------------------\\提前IPv6网络
--| EdgeDeweigh.java ------------------------\\对于网络文件去重,缩小文件体积,注意有向和无向
--| FileTool.java ---------------------------\\文件操作类
--| MathTool.java ---------------------------\\数学操作类
--| MapTool.java ----------------------------\\Map类型操作类,排序和查找
--| Link.java -------------------------------\\链路类,描述一条网络中的链路
--| Pair.java -------------------------------\\节点对类,A-B
--| PairList.java ---------------------------\\List<Pair>
--| PairMap.java ----------------------------\\Map<Key, Pair>
--| PairSet.java ----------------------------\\Set<Pair>
--| FibonacciHeap.java ----------------------\\斐波那契数据结构的实现
--| D.java ----------------------------------\\测试类
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